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Nanophotometer®可以測量的樣品種類,是用(yòng)戶關心的問題。特别是經常測量的核酸類樣品,我們一般用(yòng)dsDNA的濃度作(zuò)爲示例,以展示設備的濃度測量範圍,而您可能(néng)會(huì)問,RNA可以測量嗎?引物可以測量嗎?短序列能(néng)測嗎?DNA納米材料能(néng)測嗎?
超微量分管光度計(jì)并不直接測量濃度,而是通過光學檢測器測量樣品的吸光值,根據朗伯-比爾定律計(jì)算(suàn)濃度的。因此,符合該定律的所有樣品均可以被測量。以NP80機型爲例,檢測器的檢測範圍爲0.02A-330A(已換算(suàn)爲10mm下(xià)吸光值),波長範圍爲200-900nm,那麽原則上(shàng)樣品的吸光值和(hé)吸收波長隻要落在這(zhè)個範圍内,都可以被測量,可獲得定量或相對(duì)定量的濃度值和(hé)其他(tā)信息。
核酸中的嘌呤和(hé)嘧啶堿基有共轭雙鍵,具有吸收紫外(wài)光的性質,其至大(dà)吸收波長在250nm-270nm之間。堿基與戊糖、磷酸形成核苷酸後,其至大(dà)吸收峰不會(huì)改變,至大(dà)吸收波長約在260nm,吸收低(dī)峰在230nm。目前通行的标準,在波長260nm處,1單位OD值的光密度相當于雙鏈DNA(dsDNA)濃度爲50ng/μl、單鏈DNA(ssDNA)濃度爲37ng/μl、RNA濃度爲40ng/μl、單鏈寡核苷酸爲33ng/μl(常規值)。
也(yě)就是說,設備測量的吸光值,乘以這(zhè)些(xiē)系數(1/ε),就可以得到(dào)對(duì)應樣品的濃度值。任何種類的核酸樣品都是可以測量的,關鍵是在軟件中正确選擇樣品種類。Nanophotometer®測量界面可選擇多種核酸樣品類型,在報(bào)告中也(yě)會(huì)有對(duì)應的方法學及消光系數顯示。也(yě)可以輸入核苷酸的序列來(lái)确定樣品具體的消光系數(可支持70萬個以上(shàng)堿基序列,但(dàn)通常用(yòng)于寡核苷酸具體消光系數的确認)。
如果錯誤地選擇了(le)樣品類型,但(dàn)已完成了(le)測量,也(yě)有兩種方法可以補救:
方法一:不擡起樣品蓋,重新選擇正确的樣品類型,再次測量。Implen的樣品壓縮法支持這(zhè)種操作(zuò),而液柱拉伸法不建議(yì)一滴樣品的多次測量。
方法二:在結果中查看(kàn)吸光值數據,手動乘以消光系數,計(jì)算(suàn)濃度。
例如:測量RNA樣品時(shí),選擇了(le)dsDNA樣品,測得濃度爲200ng/μl,則樣品實際濃度應爲160ng/μl(200/50×40ng/μl)(暫不考慮很(hěn)小(xiǎo)的背景校正)。
對(duì)于蛋白(bái)質應用(yòng),原理(lǐ)相同,根據0.02-330A的吸光值檢測範圍,結合蛋白(bái)質的消光系數ε,可确定任意蛋白(bái)質樣品的濃度檢測範圍。如BSA(消光系數0.667)檢測範圍爲0.03-478mg/ml,則某消光系數爲1.33的單抗樣品檢測範圍即爲0.015-239mg/ml。實際的線性範圍需要根據樣品情況具體測試。
Nanophotmeter®基于紫外(wài)-可見吸收光譜的測量,不但(dàn)可以勝任各種核酸和(hé)蛋白(bái)質的定量,還具備全光譜測量的優異性能(néng),Implen在分析化學領域也(yě)具有廣泛的應用(yòng)。樣品壓縮法的一大(dà)特點就是良好(hǎo)的樣品兼容性,推出的4096陣列CMOS檢測器也(yě)使測量的可靠性進一步提高(gāo)。對(duì)于多樣化的樣本測量,Implen可以充分滿足用(yòng)戶的期望。
轉載:江西立康公衆号 鏈接:https://mp.weixin.qq.com/s/rFeCiftwwKivc3_HSeq9ig