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    qPCR基線和(hé)阈值的概念及設置方法

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    圖2.擴增曲線顯示了(le)設置不當的基線 (A) 和(hé)設置正确的基線 (B)。



    阈值的設置

    Applied Biosystems™提供兩種阈值設置方法:自(zì)動和(hé)手動。自(zì)動設置中,軟件将自(zì)動選擇阈值,此阈值更适合平台更高(gāo)的曲線 (圖3中的藍色曲線)。然而這(zhè)将導緻此數據組中的紅(hóng)色曲線的 Ct 值出現(xiàn)偏差,因爲其至佳阈值比此值更低(dī)。通常情況下(xià),默認設置通常已十分适當,但(dàn)也(yě)可将阈值手動拖至指數期中間,以獲得更高(gāo)的準确度。因此,需對(duì)每個數據組進行獨立研究,這(zhè)樣才能(néng)根據具體情形選擇至佳阈值。


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    圖3.對(duì)數曲線屏幕截圖顯示了(le)兩組曲線,它們的平台高(gāo)度和(hé)指數期不同。擴增曲線中确定 Ct 的至準确部分位于對(duì)數曲線指數期的中間。至佳阈值設置有時(shí)因各組數據的不同而異。


    轉載: 江西立康 公衆号 鏈接:https://mp.weixin.qq.com/s/pI_PVK4yUZcb7FH7ZoKMZA



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